目的探讨肺泡灌洗液病原微生物宏基因检测（mNGS）在儿童重症肺炎治疗中的应用价值。方法回顾分析2018年12月至2020年12月我院儿科PICU收治的重症肺炎并送检肺泡灌洗液病原学微生物mNGS检测的患儿120例,收集患儿的一般临床资料,分别采用传统检测方法以及mNGS报告判断患儿病原体类型。以临床综合判断（采用肺泡灌洗液、痰液、血液等结合评估）为金标准,评估mNGS、传统微生物学报告与临床判断的符合率。分析mNGS检测后患儿的治疗调整情况,观察治疗效果。结果在120例患者中,经传统检测提示病毒、G+菌、G-菌、真菌、支原体、衣原体分别为8例、7例、11例、1例、9例、2例（其中有5例混合感染）。经mNGS检测提示病毒、G+菌、G-菌、真菌、支原体、衣原体分别为27例、9例、17例、1例、49例、5例（其中有11例混合感染）。临床综合判断提示,病毒、G+菌、G-菌、真菌、支原体、衣原体分别为28例、9例、16例、1例、42例、4例（其中有10例混合感染）。mNGS检出阳性率显著高于传统检测结果（80.83%vs 27.50%,P(0.01）。与临床综合判定相比,mNGS符合率亦显著高于传统检测结果（80.00%vs 18.89%,P(0.01）。有29例患儿根据mNGS结果调整治疗,其中21例调整治疗后,临床症状明显改善。结论重症肺炎患儿应用肺泡灌洗液病原学微生物mNGS检测,可提高病原检出阳性率,且能对治疗方案进行调整,促进预后改善。