为了研究不同来源黄连花薹的自由基清除活性及其物质基础，对不同来源黄连花薹（湖北省利川市味连、重庆市石柱县味连、四川省洪雅县雅连和云南省福贡县云连）乙醇提取物中总酚、总花青素、总生物碱、总黄酮及蒙花苷的含量进行检测，对其清除DPPH自由基（DPPH·）、ABTS自由基(ABTS·+)和超氧阴离子自由基(O2·-)的活性进行分析。结果表明：总酚与总黄酮含量以雅连花薹乙醇提取物中最高，分别为118.26±7.07 mg/g（以没食子酸计）和78.39±4.92 mg/g（以芦丁计）；总花青素与总生物碱含量以云连花薹乙醇提取物中最高，分别为9.83±2.00 mg/g（以儿茶素计）和86.46±0.38 mg/g（以盐酸小檗碱计）；利川味连与石柱味连花薹中总生物碱含量间无显著性差异（P＞0.05）。不同来源黄连花薹乙醇提取物对DPPH·、ABTS·+和O2·-的清除活性由强到弱依次为：雅连花薹、石柱味连花薹、利川味连花薹及云连花薹。蒙花苷对DPPH·、ABTS·+和O2·-的清除活性均较低，分别为4.88%～5.54%、12.17%～16.82%和11.37%～12.21%。分子对接结果表明，影响蒙花苷清除自由基活性的主要原因是蒙花苷给电子能力较弱，推测这是蒙花苷对3种自由基的清除活性贡献率较低的内在原因。