目的：发生在非经典剪接区域的基因突变是遗传性心肌病的重要致病因素。目前研究者已经开发了多种软件来预测变异对可变剪接的影响。然而，这些预测软件在遗传性心肌病基因诊断中的应用尚不明确。因此，本研究拟评估相关软件的预测性能，并探讨这些预测软件在肥厚型心肌病（HCM）患者中的临床应用。方法：对1 212名散发性肥厚型心肌病患者进行全外显子组测序（WES），并从公开发表研究中收集引起HCM相关基因可变剪接的突变位点。基于剪接区域特异性的策略来评估剪接变异预测软件的性能，找到针对各个区域的最优预测软件来筛选候选剪接变异，最后在体外HEK293细胞中通过Minigene实验来验证这些变异的剪接结果。结果：性能评估表明，各个剪接区域的最佳预测软件分别是Pangolin（深外显子、核心供体和扩展供体区）、MLCsplice（扩展供体、核心受体和扩展受体区）、MMSplice和SpliceAI（扩展供体区）。本研究在4.5%（54/1 212）的散发性肥厚型心肌病病例中预测得到43个“优先变异”，其中有23个变异经实验证实会导致异常剪接。结论：基于剪接区域特异性预测方法可以有效识别剪接变异，从而提高遗传性心肌病基因检测的诊断率。